Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARTPTQ16568 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARTPTQ16568 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARTPTQ16568 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARTPTQ16568 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARTPTQ16568 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARTPTQ16568 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CARTPTQ16568 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARTPTQ16568 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CARTPTQ16568 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARTPTQ16568 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms