Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB1Q16558 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB1Q16558 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB1Q16558 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB1Q16558 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB1Q16558 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB1Q16558 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB1Q16558 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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