Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX2Q16385 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX2Q16385 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX2Q16385 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSX2Q16385 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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