Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX1Q16384 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX1Q16384 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX1Q16384 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX1Q16384 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX1Q16384 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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