Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB3Q15768 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB3Q15768 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNB3Q15768 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB3Q15768 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB3Q15768 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB3Q15768 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms