Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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