Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23BQ15437 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23BQ15437 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC23BQ15437 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC23BQ15437 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC23BQ15437 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC23BQ15437 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms