Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB35Q15286 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB35Q15286 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB35Q15286 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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