Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNAB1Q14722 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNAB1Q14722 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNAB1Q14722 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB1Q14722 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB1Q14722 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB1Q14722 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNAB1Q14722 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms