Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCD11Q14690 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCD11Q14690 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCD11Q14690 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCD11Q14690 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCD11Q14690 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCD11Q14690 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCD11Q14690 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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