Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC3Q14574 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DSC3Q14574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSC3Q14574 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DSC3Q14574 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSC3Q14574 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSC3Q14574 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSC3Q14574 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSC3Q14574 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC3Q14574 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms