Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARB2Q14108 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB2Q14108 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARB2Q14108 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARB2Q14108 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB2Q14108 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms