Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2H3Q13889 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2H3Q13889 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2H3Q13889 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2H3Q13889 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H3Q13889 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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