Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL4BQ13620 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL4BQ13620 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CUL4BQ13620 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL4BQ13620 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CUL4BQ13620 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL4BQ13620 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CUL4BQ13620 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL4BQ13620 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4BQ13620 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4BQ13620 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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