Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SQSTM1Q13501 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SQSTM1Q13501 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SQSTM1Q13501 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQSTM1Q13501 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQSTM1Q13501 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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