Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJC3Q13217 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJC3Q13217 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAJC3Q13217 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAJC3Q13217 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC3Q13217 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC3Q13217 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC3Q13217 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC3Q13217 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC3Q13217 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC3Q13217 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms