Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
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