Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RASGEF1BQ0VAM2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASGEF1BQ0VAM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASGEF1BQ0VAM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASGEF1BQ0VAM2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1BQ0VAM2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms