Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CAMSAP2Q08AD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CAMSAP2Q08AD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CAMSAP2Q08AD1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CAMSAP2Q08AD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CAMSAP2Q08AD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CAMSAP2Q08AD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CAMSAP2Q08AD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CAMSAP2Q08AD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CAMSAP2Q08AD1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CAMSAP2Q08AD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
CAMSAP2Q08AD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CAMSAP2Q08AD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CAMSAP2Q08AD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CAMSAP2Q08AD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CAMSAP2Q08AD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms