Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUDPQ08623 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUDPQ08623 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PUDPQ08623 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms