Protein–RNA interactions for Protein: Q06190

PPP2R3A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R3AQ06190 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP2R3AQ06190 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP2R3AQ06190 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP2R3AQ06190 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP2R3AQ06190 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms