Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC47.02■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ERCC6Q03468 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
ERCC6Q03468 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
ERCC6Q03468 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
ERCC6Q03468 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
ERCC6Q03468 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ERCC6Q03468 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ERCC6Q03468 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC46.94■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
ERCC6Q03468 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
ERCC6Q03468 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
ERCC6Q03468 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
ERCC6Q03468 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
ERCC6Q03468 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
ERCC6Q03468 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ERCC6Q03468 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ERCC6Q03468 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
ERCC6Q03468 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ERCC6Q03468 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
ERCC6Q03468 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
ERCC6Q03468 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ERCC6Q03468 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
ERCC6Q03468 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
ERCC6Q03468 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ERCC6Q03468 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
ERCC6Q03468 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
ERCC6Q03468 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ERCC6Q03468 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC46.58■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC46.58■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
ERCC6Q03468 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ERCC6Q03468 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
ERCC6Q03468 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
ERCC6Q03468 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
ERCC6Q03468 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
ERCC6Q03468 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.03
ERCC6Q03468 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
ERCC6Q03468 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.01
ERCC6Q03468 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ERCC6Q03468 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ERCC6Q03468 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ERCC6Q03468 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
ERCC6Q03468 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
ERCC6Q03468 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
ERCC6Q03468 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC46.31■■■■■ 5
ERCC6Q03468 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
ERCC6Q03468 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ERCC6Q03468 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ERCC6Q03468 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
ERCC6Q03468 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
ERCC6Q03468 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 5
ERCC6Q03468 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC46.25■■■■■ 5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms