Protein–RNA interactions for Protein: Q02833

RASSF7, Ras association domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF7Q02833 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms