Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP2B2Q01814 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B2Q01814 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B2Q01814 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ATP2B2Q01814 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATP2B2Q01814 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP2B2Q01814 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP2B2Q01814 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms