Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SKOR1P84550 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SKOR1P84550 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SKOR1P84550 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKOR1P84550 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKOR1P84550 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms