Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS25P82663 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS25P82663 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPS25P82663 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS25P82663 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS25P82663 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms