Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX1P78414 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX1P78414 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX1P78414 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX1P78414 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX1P78414 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX1P78414 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX1P78414 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRX1P78414 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX1P78414 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRX1P78414 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRX1P78414 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX1P78414 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX1P78414 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX1P78414 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX1P78414 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX1P78414 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX1P78414 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX1P78414 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX1P78414 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX1P78414 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX1P78414 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX1P78414 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX1P78414 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX1P78414 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX1P78414 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX1P78414 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX1P78414 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX1P78414 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX1P78414 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX1P78414 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX1P78414 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX1P78414 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX1P78414 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX1P78414 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX1P78414 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX1P78414 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX1P78414 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX1P78414 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX1P78414 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX1P78414 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX1P78414 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX1P78414 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX1P78414 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX1P78414 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX1P78414 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX1P78414 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX1P78414 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX1P78414 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX1P78414 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX1P78414 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX1P78414 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX1P78414 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX1P78414 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX1P78414 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX1P78414 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX1P78414 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX1P78414 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX1P78414 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX1P78414 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX1P78414 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX1P78414 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX1P78414 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX1P78414 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX1P78414 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX1P78414 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX1P78414 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX1P78414 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX1P78414 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX1P78414 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX1P78414 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX1P78414 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX1P78414 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX1P78414 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX1P78414 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX1P78414 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX1P78414 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX1P78414 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX1P78414 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX1P78414 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX1P78414 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX1P78414 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX1P78414 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX1P78414 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX1P78414 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX1P78414 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX1P78414 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX1P78414 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX1P78414 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX1P78414 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX1P78414 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX1P78414 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX1P78414 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX1P78414 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms