Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTAG1AP78358 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTAG1AP78358 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTAG1AP78358 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTAG1AP78358 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTAG1AP78358 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTAG1AP78358 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTAG1AP78358 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTAG1AP78358 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTAG1AP78358 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTAG1AP78358 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms