Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNNC1P63316 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNC1P63316 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNC1P63316 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNC1P63316 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNC1P63316 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNC1P63316 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNC1P63316 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms