Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAP1AP62834 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAP1AP62834 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1AP62834 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAP1AP62834 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAP1AP62834 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1AP62834 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP1AP62834 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms