Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCN6P62502 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCN6P62502 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCN6P62502 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCN6P62502 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCN6P62502 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCN6P62502 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCN6P62502 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN6P62502 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN6P62502 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN6P62502 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN6P62502 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN6P62502 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCN6P62502 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCN6P62502 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCN6P62502 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCN6P62502 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCN6P62502 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCN6P62502 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN6P62502 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCN6P62502 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCN6P62502 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN6P62502 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN6P62502 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN6P62502 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN6P62502 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCN6P62502 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCN6P62502 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCN6P62502 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN6P62502 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN6P62502 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN6P62502 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCN6P62502 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCN6P62502 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCN6P62502 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN6P62502 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN6P62502 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN6P62502 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN6P62502 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN6P62502 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN6P62502 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCN6P62502 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCN6P62502 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCN6P62502 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCN6P62502 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCN6P62502 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCN6P62502 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCN6P62502 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCN6P62502 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN6P62502 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN6P62502 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN6P62502 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN6P62502 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCN6P62502 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN6P62502 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN6P62502 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN6P62502 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN6P62502 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN6P62502 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN6P62502 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN6P62502 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN6P62502 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN6P62502 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN6P62502 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN6P62502 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN6P62502 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN6P62502 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN6P62502 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN6P62502 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN6P62502 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN6P62502 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN6P62502 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN6P62502 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN6P62502 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms