Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V0D1P61421 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V0D1P61421 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V0D1P61421 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V0D1P61421 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V0D1P61421 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V0D1P61421 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V0D1P61421 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V0D1P61421 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V0D1P61421 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V0D1P61421 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V0D1P61421 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms