Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM258P61165 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM258P61165 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM258P61165 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.5 ms