Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARPC4P59998 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC4P59998 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC4P59998 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARPC4P59998 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC4P59998 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms