Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LOXL3P58215 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXL3P58215 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXL3P58215 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXL3P58215 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms