Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX16P57768 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX16P57768 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX16P57768 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX16P57768 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX16P57768 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX16P57768 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX16P57768 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX16P57768 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX16P57768 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX16P57768 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX16P57768 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX16P57768 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX16P57768 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX16P57768 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX16P57768 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX16P57768 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX16P57768 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX16P57768 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX16P57768 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX16P57768 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX16P57768 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX16P57768 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX16P57768 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX16P57768 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX16P57768 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX16P57768 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX16P57768 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX16P57768 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX16P57768 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX16P57768 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX16P57768 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX16P57768 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX16P57768 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX16P57768 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX16P57768 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX16P57768 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX16P57768 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX16P57768 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX16P57768 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX16P57768 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX16P57768 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX16P57768 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX16P57768 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX16P57768 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX16P57768 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX16P57768 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNX16P57768 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX16P57768 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX16P57768 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX16P57768 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNX16P57768 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX16P57768 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX16P57768 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SNX16P57768 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX16P57768 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX16P57768 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX16P57768 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX16P57768 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX16P57768 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX16P57768 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX16P57768 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX16P57768 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX16P57768 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX16P57768 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX16P57768 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX16P57768 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX16P57768 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX16P57768 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX16P57768 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX16P57768 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX16P57768 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX16P57768 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX16P57768 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX16P57768 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX16P57768 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX16P57768 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX16P57768 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX16P57768 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX16P57768 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX16P57768 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX16P57768 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX16P57768 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX16P57768 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX16P57768 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX16P57768 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX16P57768 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX16P57768 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms