Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN17P56750 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN17P56750 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN17P56750 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN17P56750 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms