Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH13P55290 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH13P55290 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH13P55290 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH13P55290 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH13P55290 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH13P55290 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH13P55290 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH13P55290 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH13P55290 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH13P55290 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH13P55290 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH13P55290 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH13P55290 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH13P55290 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDH13P55290 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH13P55290 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH13P55290 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH13P55290 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH13P55290 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH13P55290 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH13P55290 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH13P55290 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH13P55290 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH13P55290 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH13P55290 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDH13P55290 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH13P55290 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH13P55290 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH13P55290 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH13P55290 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH13P55290 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH13P55290 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH13P55290 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH13P55290 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH13P55290 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH13P55290 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH13P55290 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH13P55290 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH13P55290 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH13P55290 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH13P55290 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH13P55290 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH13P55290 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH13P55290 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH13P55290 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH13P55290 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH13P55290 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH13P55290 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH13P55290 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH13P55290 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH13P55290 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH13P55290 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH13P55290 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH13P55290 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH13P55290 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH13P55290 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH13P55290 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH13P55290 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH13P55290 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH13P55290 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH13P55290 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH13P55290 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH13P55290 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH13P55290 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH13P55290 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH13P55290 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH13P55290 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH13P55290 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH13P55290 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH13P55290 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH13P55290 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH13P55290 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH13P55290 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH13P55290 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH13P55290 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH13P55290 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH13P55290 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH13P55290 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH13P55290 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH13P55290 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH13P55290 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH13P55290 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH13P55290 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH13P55290 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH13P55290 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH13P55290 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH13P55290 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH13P55290 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH13P55290 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH13P55290 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH13P55290 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH13P55290 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH13P55290 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms