Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA8P53708 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA8P53708 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA8P53708 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA8P53708 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA8P53708 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA8P53708 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms