Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMSP52788 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMSP52788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMSP52788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMSP52788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMSP52788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMSP52788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMSP52788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMSP52788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMSP52788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMSP52788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMSP52788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMSP52788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMSP52788 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMSP52788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMSP52788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMSP52788 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMSP52788 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMSP52788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMSP52788 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMSP52788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMSP52788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMSP52788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMSP52788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMSP52788 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMSP52788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMSP52788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMSP52788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMSP52788 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMSP52788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMSP52788 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMSP52788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMSP52788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMSP52788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMSP52788 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMSP52788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMSP52788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMSP52788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMSP52788 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMSP52788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMSP52788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMSP52788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMSP52788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMSP52788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMSP52788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMSP52788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMSP52788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMSP52788 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMSP52788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMSP52788 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMSP52788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMSP52788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMSP52788 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMSP52788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMSP52788 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMSP52788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMSP52788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMSP52788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMSP52788 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMSP52788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMSP52788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMSP52788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMSP52788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMSP52788 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMSP52788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMSP52788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMSP52788 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMSP52788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMSP52788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMSP52788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMSP52788 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMSP52788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMSP52788 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMSP52788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMSP52788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMSP52788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMSP52788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMSP52788 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMSP52788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMSP52788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMSP52788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms