Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRCA2P51587 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRCA2P51587 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRCA2P51587 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRCA2P51587 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRCA2P51587 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRCA2P51587 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRCA2P51587 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms