Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DAP3P51398 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DAP3P51398 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DAP3P51398 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DAP3P51398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DAP3P51398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DAP3P51398 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DAP3P51398 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DAP3P51398 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DAP3P51398 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DAP3P51398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DAP3P51398 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DAP3P51398 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DAP3P51398 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DAP3P51398 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DAP3P51398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DAP3P51398 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DAP3P51398 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DAP3P51398 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DAP3P51398 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DAP3P51398 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DAP3P51398 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DAP3P51398 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DAP3P51398 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DAP3P51398 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DAP3P51398 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DAP3P51398 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DAP3P51398 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DAP3P51398 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DAP3P51398 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DAP3P51398 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DAP3P51398 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DAP3P51398 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DAP3P51398 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DAP3P51398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DAP3P51398 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DAP3P51398 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DAP3P51398 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DAP3P51398 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DAP3P51398 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DAP3P51398 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DAP3P51398 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DAP3P51398 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DAP3P51398 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DAP3P51398 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DAP3P51398 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DAP3P51398 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DAP3P51398 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DAP3P51398 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DAP3P51398 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DAP3P51398 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DAP3P51398 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DAP3P51398 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DAP3P51398 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DAP3P51398 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DAP3P51398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DAP3P51398 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DAP3P51398 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DAP3P51398 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DAP3P51398 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DAP3P51398 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DAP3P51398 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DAP3P51398 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DAP3P51398 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DAP3P51398 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DAP3P51398 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DAP3P51398 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DAP3P51398 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DAP3P51398 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DAP3P51398 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DAP3P51398 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DAP3P51398 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DAP3P51398 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DAP3P51398 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DAP3P51398 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DAP3P51398 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DAP3P51398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DAP3P51398 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DAP3P51398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DAP3P51398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DAP3P51398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DAP3P51398 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DAP3P51398 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DAP3P51398 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DAP3P51398 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DAP3P51398 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DAP3P51398 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DAP3P51398 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DAP3P51398 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DAP3P51398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DAP3P51398 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DAP3P51398 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DAP3P51398 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DAP3P51398 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.2 ms