Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE6CP51160 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE6CP51160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6CP51160 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6CP51160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.3 ms