Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUMBP49757 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUMBP49757 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUMBP49757 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUMBP49757 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUMBP49757 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUMBP49757 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUMBP49757 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUMBP49757 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUMBP49757 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUMBP49757 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUMBP49757 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUMBP49757 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUMBP49757 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUMBP49757 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUMBP49757 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUMBP49757 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUMBP49757 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUMBP49757 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUMBP49757 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUMBP49757 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUMBP49757 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUMBP49757 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUMBP49757 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUMBP49757 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUMBP49757 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUMBP49757 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUMBP49757 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUMBP49757 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUMBP49757 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUMBP49757 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUMBP49757 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUMBP49757 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUMBP49757 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUMBP49757 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUMBP49757 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUMBP49757 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUMBP49757 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUMBP49757 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUMBP49757 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUMBP49757 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUMBP49757 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUMBP49757 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUMBP49757 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUMBP49757 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUMBP49757 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUMBP49757 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUMBP49757 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUMBP49757 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUMBP49757 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUMBP49757 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NUMBP49757 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUMBP49757 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUMBP49757 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUMBP49757 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUMBP49757 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUMBP49757 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUMBP49757 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUMBP49757 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUMBP49757 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUMBP49757 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUMBP49757 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUMBP49757 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUMBP49757 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUMBP49757 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUMBP49757 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUMBP49757 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUMBP49757 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUMBP49757 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUMBP49757 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUMBP49757 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUMBP49757 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUMBP49757 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUMBP49757 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUMBP49757 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUMBP49757 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUMBP49757 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUMBP49757 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUMBP49757 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUMBP49757 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUMBP49757 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUMBP49757 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUMBP49757 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUMBP49757 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUMBP49757 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUMBP49757 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUMBP49757 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUMBP49757 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUMBP49757 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUMBP49757 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUMBP49757 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUMBP49757 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUMBP49757 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUMBP49757 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUMBP49757 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUMBP49757 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUMBP49757 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUMBP49757 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUMBP49757 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUMBP49757 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms