Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT3P49368 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT3P49368 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT3P49368 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT3P49368 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT3P49368 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT3P49368 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT3P49368 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT3P49368 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT3P49368 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT3P49368 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT3P49368 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT3P49368 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT3P49368 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT3P49368 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT3P49368 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT3P49368 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT3P49368 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT3P49368 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT3P49368 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT3P49368 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT3P49368 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT3P49368 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT3P49368 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT3P49368 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT3P49368 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT3P49368 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT3P49368 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT3P49368 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT3P49368 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT3P49368 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT3P49368 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT3P49368 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT3P49368 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT3P49368 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT3P49368 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT3P49368 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT3P49368 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT3P49368 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT3P49368 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT3P49368 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT3P49368 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT3P49368 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT3P49368 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT3P49368 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT3P49368 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT3P49368 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT3P49368 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT3P49368 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT3P49368 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT3P49368 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT3P49368 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT3P49368 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT3P49368 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT3P49368 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT3P49368 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT3P49368 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT3P49368 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT3P49368 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT3P49368 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT3P49368 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT3P49368 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT3P49368 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT3P49368 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT3P49368 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT3P49368 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT3P49368 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT3P49368 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT3P49368 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT3P49368 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT3P49368 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT3P49368 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT3P49368 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT3P49368 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT3P49368 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT3P49368 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT3P49368 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT3P49368 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT3P49368 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT3P49368 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT3P49368 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT3P49368 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT3P49368 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT3P49368 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT3P49368 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT3P49368 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT3P49368 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT3P49368 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT3P49368 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT3P49368 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT3P49368 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT3P49368 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT3P49368 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT3P49368 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT3P49368 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT3P49368 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT3P49368 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT3P49368 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT3P49368 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT3P49368 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms