Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK1A1P48729 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1A1P48729 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK1A1P48729 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1A1P48729 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSNK1A1P48729 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CSNK1A1P48729 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms