Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNJ1P48048 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNJ1P48048 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNJ1P48048 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNJ1P48048 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNJ1P48048 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNJ1P48048 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNJ1P48048 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNJ1P48048 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNJ1P48048 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms