Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALDH1A3P47895 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALDH1A3P47895 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALDH1A3P47895 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALDH1A3P47895 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1A3P47895 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms