Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP3P42574 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP3P42574 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP3P42574 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP3P42574 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP3P42574 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP3P42574 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP3P42574 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP3P42574 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP3P42574 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP3P42574 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP3P42574 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP3P42574 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP3P42574 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP3P42574 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP3P42574 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP3P42574 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP3P42574 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP3P42574 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP3P42574 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP3P42574 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP3P42574 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP3P42574 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP3P42574 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP3P42574 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP3P42574 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP3P42574 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP3P42574 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP3P42574 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP3P42574 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP3P42574 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP3P42574 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP3P42574 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP3P42574 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP3P42574 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP3P42574 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP3P42574 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP3P42574 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP3P42574 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP3P42574 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP3P42574 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP3P42574 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP3P42574 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP3P42574 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP3P42574 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP3P42574 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP3P42574 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP3P42574 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP3P42574 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP3P42574 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP3P42574 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP3P42574 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP3P42574 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP3P42574 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP3P42574 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP3P42574 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP3P42574 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP3P42574 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP3P42574 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP3P42574 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP3P42574 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP3P42574 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP3P42574 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP3P42574 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP3P42574 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP3P42574 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP3P42574 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP3P42574 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP3P42574 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP3P42574 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP3P42574 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP3P42574 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP3P42574 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP3P42574 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP3P42574 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP3P42574 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP3P42574 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP3P42574 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP3P42574 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP3P42574 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP3P42574 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP3P42574 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP3P42574 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP3P42574 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP3P42574 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP3P42574 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP3P42574 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP3P42574 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms