Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNFP41002 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNFP41002 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNFP41002 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNFP41002 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNFP41002 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNFP41002 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNFP41002 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNFP41002 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNFP41002 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNFP41002 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNFP41002 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNFP41002 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNFP41002 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNFP41002 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNFP41002 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNFP41002 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNFP41002 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNFP41002 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNFP41002 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNFP41002 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNFP41002 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNFP41002 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNFP41002 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNFP41002 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNFP41002 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNFP41002 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNFP41002 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNFP41002 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNFP41002 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNFP41002 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNFP41002 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNFP41002 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNFP41002 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNFP41002 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNFP41002 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNFP41002 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNFP41002 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNFP41002 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNFP41002 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNFP41002 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNFP41002 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNFP41002 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNFP41002 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNFP41002 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNFP41002 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNFP41002 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNFP41002 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNFP41002 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNFP41002 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNFP41002 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNFP41002 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNFP41002 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCNFP41002 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNFP41002 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNFP41002 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNFP41002 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNFP41002 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNFP41002 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNFP41002 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNFP41002 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNFP41002 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNFP41002 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNFP41002 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNFP41002 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNFP41002 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNFP41002 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNFP41002 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNFP41002 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNFP41002 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNFP41002 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNFP41002 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNFP41002 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNFP41002 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNFP41002 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNFP41002 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNFP41002 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNFP41002 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCNFP41002 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCNFP41002 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNFP41002 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNFP41002 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNFP41002 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNFP41002 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNFP41002 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNFP41002 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNFP41002 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNFP41002 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNFP41002 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNFP41002 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNFP41002 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNFP41002 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNFP41002 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNFP41002 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms