Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMELP40967 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMELP40967 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMELP40967 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMELP40967 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMELP40967 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMELP40967 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMELP40967 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMELP40967 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMELP40967 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMELP40967 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMELP40967 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMELP40967 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMELP40967 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMELP40967 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMELP40967 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMELP40967 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMELP40967 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMELP40967 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PMELP40967 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMELP40967 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMELP40967 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMELP40967 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMELP40967 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMELP40967 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMELP40967 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PMELP40967 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMELP40967 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMELP40967 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMELP40967 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMELP40967 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMELP40967 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMELP40967 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMELP40967 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMELP40967 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMELP40967 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMELP40967 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMELP40967 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMELP40967 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMELP40967 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMELP40967 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMELP40967 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMELP40967 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMELP40967 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMELP40967 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMELP40967 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMELP40967 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMELP40967 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMELP40967 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMELP40967 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMELP40967 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMELP40967 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMELP40967 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMELP40967 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMELP40967 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMELP40967 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMELP40967 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMELP40967 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMELP40967 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PMELP40967 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMELP40967 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMELP40967 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMELP40967 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMELP40967 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMELP40967 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMELP40967 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMELP40967 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMELP40967 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMELP40967 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMELP40967 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMELP40967 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMELP40967 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMELP40967 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMELP40967 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMELP40967 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMELP40967 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMELP40967 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMELP40967 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMELP40967 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMELP40967 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PMELP40967 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMELP40967 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMELP40967 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMELP40967 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMELP40967 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMELP40967 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMELP40967 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMELP40967 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms